社殿は標高約５１５ｍに位置し、そこにはシイノキを主体とする群落を形成しています。これより奥の標高６００〜７００ｍの地にはウロジガシ、ハイノキを主とする群落があり、地表にはヤブコウジやミヤマトベラなどが見られます。標高８００〜９００ｍの地には、ブナ、ミズラナを主とする群落があらわれ、地表にはチマキザサが生育しています。さらに高いところでは、植生が疎となり、アカマツ林があらわれ、コバノミツバツツジが混生しています。海抜高による植生の変化が観察され、しかも人跡が稀であるため、原生状態をよくとどめています。